Kapag ang tubig ay pumasok sa sistema ng EDI at ang isang electric current ay inilapat, ang mga cation at anion sa tubig ay naaakit sa kaukulang mga electrodes at tinanggal. Ang prosesong ito ay hindi nangangailangan ng mga kemikal na reagents at maaaring epektibong maglinis ng mga pinagmumulan ng tubig at magbigay ng mataas na kalidad na tubig.